MOTTO Â Â Â Â :Â Â Â Â Â "GLORIA DEI VIVENS HOMO"
LOGO
Lambang Institut Agama Kristen Negeri (IAKN) Ambon terdiri atas unsur yang memiliki makna :
a. Gambar Alkitab yang terbuka lebar melambangkan firman Allah sebagai dasar ilmu pengetahuan dan kebijaksanaan bagi semua orang;
c. Gambar salib berwarna ungu membingkai Alkitab melambangkan kasih, perjuangan, pengorbanan dan kesetiaan;
d. Garis biru melambangkan keteguhan berjuang dalam tantangan geografis, sosio budaya, dan politik di wilayah kepulauan;
e. Burung merpati berwarna putih melambangkan Roh Kudus yang senantiasa membimbing;
f.  Daun, buah cengkih, dan pala berwarna hijau, kuning dan merah melambangkan hasil kekayaan Kepulauan Maluku dan cita-cita luhur menebarkan aroma kehidupan yang damai dan bermartabat; dan
g. Tulisan IAKN AMBON berwarna putih dalam pita hijau yang melingkari cengkih dan pala melambangkan kesucian dan keteguhan hati untuk menghadirkan karya yang bermanfaat bagi semesta untuk kemuliaan Sang Pencipta.
